Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp6r1Q7TSI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp6r1Q7TSI3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp6r1Q7TSI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms