Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LnpkQ7TQ95 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LnpkQ7TQ95 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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