Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS5

B630019K06Rik, RIKEN cDNA B630019K06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B630019K06RikQ7TNS5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B630019K06RikQ7TNS5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B630019K06RikQ7TNS5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms