Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphp3Q7TNH6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nphp3Q7TNH6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nphp3Q7TNH6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms