Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms