Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rhox8Q6VSS7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rhox8Q6VSS7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rhox8Q6VSS7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms