Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc35e3Q6PGC7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35e3Q6PGC7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms