Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23ipQ6NZC7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23ipQ6NZC7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms