Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmcc1Q69ZZ6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms