Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PnkdQ69ZP3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms