Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zfp248Q640N4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zfp248Q640N4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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