Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt33bQ61897 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt33bQ61897 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms