Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms