Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms