Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms