Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palb2Q3U0P1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms