Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88bQ3TYP4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms