Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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