Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 PAH1YMR165C 2589 nt5.54□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 SNT2YGL131C 4212 nt5.54□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 TRX3YCR083W 384 nt5.54□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 TUB2YFL037W 1374 nt5.54□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 EAP1YKL204W 1899 nt5.54□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 RED1YLR263W 2484 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 RIP1YEL024W 648 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 MIC19YFR011C 513 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 EPT1YHR123W 1176 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 HTB2YBL002W 396 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 DSF2YBR007C 2211 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YND1YER005W 1893 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 SRP68YPL243W 1800 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 HSP82YPL240C 2130 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YRR1YOR162C 2433 nt5.53□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 NRD1YNL251C 1728 nt5.52□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 EMI1YDR512C 564 nt5.52□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt5.52□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt5.51□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 MNT2YGL257C 1677 nt5.51□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 FHL1YPR104C 2811 nt5.51□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 PCC1YKR095W-A 267 nt5.51□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 RRT15YLR162W-A 189 nt5.51□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 PHO88YBR106W 567 nt5.51□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 snR45snR45 172 nt5.51□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YOL019WYOL019W 1656 nt5.5□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 UBX2YML013W 1755 nt5.5□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 HTA1YDR225W 399 nt5.5□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 ATG33YLR356W 594 nt5.5□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 HOR7YMR251W-A 180 nt5.5□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt5.5□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 MNN2YBR015C 1794 nt5.5□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 SIF2YBR103W 1608 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 AEP3YPL005W 1821 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YDR426CYDR426C 378 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 SPI1YER150W 447 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 CDC26YFR036W 375 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 BAT1YHR208W 1182 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 TOF2YKR010C 2316 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 DPH6YLR143W 2058 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 HPR1YDR138W 2259 nt5.49□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 UTP15YMR093W 1542 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 EMP70YLR083C 2004 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 ELP2YGR200C 2367 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YKL100CYKL100C 1764 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 URM1YIL008W 300 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YMR321CYMR321C 318 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 ATP15YPL271W 189 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 TOM5YPR133W-A 153 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 HOP1YIL072W 1818 nt5.48□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 MIH1YMR036C 1665 nt5.47□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 PRR1YKL116C 1557 nt5.47□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 RPL14BYHL001W 417 nt5.47□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 YJL132WYJL132W 2253 nt5.47□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 SSA2YLL024C 1920 nt5.46□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 PUF2YPR042C 3228 nt5.46□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 ERG7YHR072W 2196 nt5.46□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 SEC6YIL068C 2418 nt5.46□□□□□ -1.53
NCR1Q12200 RRT13YER066W 558 nt5.46□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 IMA1YGR287C 1770 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 MPP10YJR002W 1782 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 MGR2YPL098C 342 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 SPO21YOL091W 1830 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 SRC1YML034W 2505 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 HRK1YOR267C 2280 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 SSP1YHR184W 1716 nt5.45□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 DAK1YML070W 1755 nt5.44□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 DAD4YDR320C-A 219 nt5.44□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 SMP3YOR149C 1551 nt5.44□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YDR061WYDR061W 1620 nt5.44□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 UBP5YER144C 2418 nt5.44□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YOR022CYOR022C 2148 nt5.44□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 ABZ1YNR033W 2364 nt5.43□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 ACS2YLR153C 2052 nt5.43□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 RPL33BYOR234C 324 nt5.43□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YBR277CYBR277C 402 nt5.43□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 PDC1YLR044C 1692 nt5.43□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 SSE1YPL106C 2082 nt5.43□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 KIN82YCR091W 2163 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YCK2YNL154C 1641 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 MZM1YDR493W 372 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 RPL11BYGR085C 525 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 APC9YLR102C 798 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 RFC3YNL290W 1023 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YOR376WYOR376W 369 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 RPL11AYPR102C 525 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YLR177WYLR177W 1887 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 MSC2YDR205W 2175 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 PDI1YCL043C 1569 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 APL6YGR261C 2430 nt5.42□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 FOL1YNL256W 2475 nt5.41□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 HPF1YOL155C 2904 nt5.41□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 CTS1YLR286C 1689 nt5.41□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 PWP1YLR196W 1731 nt5.41□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YEL077CYEL077C 3834 nt5.41□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.41□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 RIM13YMR154C 2184 nt5.4□□□□□ -1.54
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