Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkpd1Q0VF94 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkpd1Q0VF94 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms