Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp2b3Q0VF55 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms