Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms