Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Msx2Q03358 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms