Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gbp1Q01514 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms