Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms