Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uba52P62984 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba52P62984 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms