Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms