Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm3P62311 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms