Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Copz1P61924 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copz1P61924 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms