Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sem1P60897 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sem1P60897 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sem1P60897 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms