Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr3bP59470 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr3bP59470 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr3bP59470 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr3bP59470 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms