Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpreP49446 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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