Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VdrP48281 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VdrP48281 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VdrP48281 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VdrP48281 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VdrP48281 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VdrP48281 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms