Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra2P26048 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabra2P26048 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms