Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms