Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptbp1P17225 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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