Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms