Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01800 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01800 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01800 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01800 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01800 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01800 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01800 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01800 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms