Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brd7O88665 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms