Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33bO35963 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab33bO35963 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms