Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-ObO35424 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-ObO35424 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms