Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ArxO35085 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ArxO35085 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ArxO35085 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ArxO35085 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ArxO35085 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ArxO35085 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ArxO35085 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ArxO35085 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ArxO35085 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ArxO35085 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ArxO35085 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ArxO35085 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms