Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClockO08785 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ClockO08785 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClockO08785 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClockO08785 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClockO08785 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClockO08785 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClockO08785 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClockO08785 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms