Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Casp6O08738 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Casp6O08738 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Casp6O08738 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp6O08738 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp6O08738 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp6O08738 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp6O08738 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms