Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21797J3QNW5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm21797J3QNW5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm21797J3QNW5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm21797J3QNW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm21797J3QNW5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21797J3QNW5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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