Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
7530416G11RikJ3QJX6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
7530416G11RikJ3QJX6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms