Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21863J3KMP8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms