Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm29394H3BIW7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm29394H3BIW7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms