Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6482F6YHC1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6482F6YHC1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms