Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Ccdc7bE9Q9Y3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ccdc7bE9Q9Y3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ccdc7bE9Q9Y3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc7bE9Q9Y3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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